Hà Nội Sun FC có mối liên hệ với Urawa Red Diamonds và Matsumoto Yamaga. Urawa Red Diamons là đối tác trao đổi kinh nghiệm quản lý, đào tạo CLB chuyên nghiệp. Còn Matsumoto Yamaga là đối tác trao đổi liên kết đào tạo cho trung tâm bóng đá Sun FC, trong đó có hoạt động trao gửi cầu thủ trẻ Việt Namsang Nhật Bản du học bóng đá.

Ngoài ra, câu lạc bộ còn được tài trợ bởi các công ty trong nước như Công ty CP Xây dựng Thương mại và Thể thao Quang Hà (do Triệu Quang Hà làm chủ), Tập đoàn Nippon Koei, Công ty CP Truyền thông Trust Media, Công ty CP XNK Việt Phát, Tập đoàn Đức Trung…